Index

A

aoutools.prs module

C

calculate_pgs() (in module aoutools.prs) calculate_prs() (in module aoutools.prs)

calculate_prs_batch() (in module aoutools.prs) chunk_size (aoutools.prs.PRSConfig attribute)

D

DEFAULT_VDS_PATH (in module aoutools)

detailed_timings (aoutools.prs.PRSConfig attribute) download_pgs() (in module aoutools.prs)

G

get_google_project() (in module aoutools)

get_vds_path() (in module aoutools) get_workspace_bucket() (in module aoutools)

I

include_n_matched (aoutools.prs.PRSConfig attribute)

init_hail() (in module aoutools)

L

log_transform_weight (aoutools.prs.PRSConfig attribute)

M

module aoutools.prs

P

PRSConfig (class in aoutools.prs)

R

read_prs_weights() (in module aoutools.prs)

read_prscs() (in module aoutools.prs)

S

sample_id_col (aoutools.prs.PRSConfig attribute)

samples_to_keep (aoutools.prs.PRSConfig attribute)

W

weight_col_name (aoutools.prs.PRSConfig attribute)